Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRXP46100 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRXP46100 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRXP46100 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRXP46100 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRXP46100 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRXP46100 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRXP46100 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRXP46100 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRXP46100 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRXP46100 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRXP46100 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRXP46100 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRXP46100 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRXP46100 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRXP46100 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRXP46100 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRXP46100 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRXP46100 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRXP46100 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATRXP46100 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRXP46100 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRXP46100 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRXP46100 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRXP46100 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRXP46100 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRXP46100 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRXP46100 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRXP46100 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRXP46100 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRXP46100 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRXP46100 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRXP46100 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRXP46100 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRXP46100 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRXP46100 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRXP46100 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRXP46100 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATRXP46100 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRXP46100 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRXP46100 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRXP46100 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRXP46100 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRXP46100 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRXP46100 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRXP46100 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRXP46100 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRXP46100 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRXP46100 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRXP46100 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRXP46100 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRXP46100 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRXP46100 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRXP46100 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRXP46100 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRXP46100 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRXP46100 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRXP46100 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRXP46100 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRXP46100 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRXP46100 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRXP46100 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRXP46100 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRXP46100 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRXP46100 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRXP46100 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRXP46100 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRXP46100 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRXP46100 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRXP46100 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRXP46100 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRXP46100 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRXP46100 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRXP46100 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRXP46100 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRXP46100 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATRXP46100 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRXP46100 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRXP46100 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRXP46100 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRXP46100 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRXP46100 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRXP46100 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRXP46100 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRXP46100 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRXP46100 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRXP46100 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRXP46100 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRXP46100 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRXP46100 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRXP46100 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRXP46100 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRXP46100 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRXP46100 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRXP46100 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRXP46100 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRXP46100 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRXP46100 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRXP46100 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATRXP46100 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms