Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGIRP43119 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms