Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPOP42166 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPOP42166 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPOP42166 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPOP42166 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPOP42166 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPOP42166 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPOP42166 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPOP42166 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPOP42166 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPOP42166 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPOP42166 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPOP42166 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMPOP42166 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPOP42166 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPOP42166 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPOP42166 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPOP42166 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPOP42166 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPOP42166 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPOP42166 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPOP42166 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPOP42166 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPOP42166 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPOP42166 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPOP42166 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPOP42166 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPOP42166 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPOP42166 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPOP42166 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPOP42166 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPOP42166 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPOP42166 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPOP42166 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPOP42166 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPOP42166 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPOP42166 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPOP42166 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPOP42166 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPOP42166 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPOP42166 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPOP42166 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPOP42166 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TMPOP42166 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPOP42166 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPOP42166 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPOP42166 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPOP42166 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPOP42166 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPOP42166 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPOP42166 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPOP42166 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPOP42166 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPOP42166 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPOP42166 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPOP42166 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPOP42166 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPOP42166 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPOP42166 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPOP42166 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPOP42166 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPOP42166 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPOP42166 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPOP42166 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPOP42166 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPOP42166 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPOP42166 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMPOP42166 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMPOP42166 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMPOP42166 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMPOP42166 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMPOP42166 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMPOP42166 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMPOP42166 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMPOP42166 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMPOP42166 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMPOP42166 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TMPOP42166 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMPOP42166 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMPOP42166 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TMPOP42166 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMPOP42166 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TMPOP42166 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMPOP42166 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMPOP42166 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMPOP42166 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMPOP42166 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMPOP42166 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMPOP42166 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMPOP42166 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMPOP42166 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMPOP42166 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMPOP42166 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMPOP42166 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMPOP42166 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMPOP42166 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMPOP42166 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TMPOP42166 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMPOP42166 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMPOP42166 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms