Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDH1P40925 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDH1P40925 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDH1P40925 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDH1P40925 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDH1P40925 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDH1P40925 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDH1P40925 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDH1P40925 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDH1P40925 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDH1P40925 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDH1P40925 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDH1P40925 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDH1P40925 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDH1P40925 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDH1P40925 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MDH1P40925 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDH1P40925 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDH1P40925 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDH1P40925 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MDH1P40925 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDH1P40925 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDH1P40925 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDH1P40925 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDH1P40925 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDH1P40925 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDH1P40925 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDH1P40925 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDH1P40925 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDH1P40925 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDH1P40925 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDH1P40925 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDH1P40925 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDH1P40925 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDH1P40925 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDH1P40925 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDH1P40925 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDH1P40925 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDH1P40925 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDH1P40925 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDH1P40925 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDH1P40925 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDH1P40925 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDH1P40925 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDH1P40925 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDH1P40925 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDH1P40925 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MDH1P40925 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDH1P40925 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDH1P40925 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDH1P40925 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDH1P40925 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDH1P40925 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDH1P40925 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDH1P40925 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms