Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCN4AP35499 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCN4AP35499 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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