Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms