Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YY1P25490 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YY1P25490 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YY1P25490 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YY1P25490 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YY1P25490 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YY1P25490 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
YY1P25490 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YY1P25490 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YY1P25490 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YY1P25490 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YY1P25490 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YY1P25490 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YY1P25490 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YY1P25490 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YY1P25490 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
YY1P25490 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
YY1P25490 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YY1P25490 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YY1P25490 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YY1P25490 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YY1P25490 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YY1P25490 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YY1P25490 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YY1P25490 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YY1P25490 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
YY1P25490 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YY1P25490 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YY1P25490 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
YY1P25490 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YY1P25490 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YY1P25490 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
YY1P25490 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
YY1P25490 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
YY1P25490 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
YY1P25490 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YY1P25490 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
YY1P25490 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YY1P25490 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YY1P25490 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
YY1P25490 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YY1P25490 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YY1P25490 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
YY1P25490 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
YY1P25490 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
YY1P25490 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
YY1P25490 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YY1P25490 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YY1P25490 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
YY1P25490 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YY1P25490 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YY1P25490 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YY1P25490 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YY1P25490 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YY1P25490 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YY1P25490 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YY1P25490 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
YY1P25490 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YY1P25490 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YY1P25490 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YY1P25490 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YY1P25490 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
YY1P25490 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YY1P25490 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
YY1P25490 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YY1P25490 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YY1P25490 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
YY1P25490 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YY1P25490 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YY1P25490 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YY1P25490 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YY1P25490 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YY1P25490 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YY1P25490 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YY1P25490 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YY1P25490 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YY1P25490 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YY1P25490 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YY1P25490 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YY1P25490 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YY1P25490 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YY1P25490 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YY1P25490 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YY1P25490 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YY1P25490 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YY1P25490 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YY1P25490 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
YY1P25490 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YY1P25490 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YY1P25490 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YY1P25490 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YY1P25490 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YY1P25490 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YY1P25490 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YY1P25490 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
YY1P25490 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YY1P25490 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YY1P25490 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YY1P25490 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YY1P25490 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms