Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRHP20396 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRHP20396 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRHP20396 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRHP20396 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRHP20396 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TRHP20396 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRHP20396 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRHP20396 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TRHP20396 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRHP20396 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TRHP20396 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TRHP20396 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRHP20396 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRHP20396 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRHP20396 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TRHP20396 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRHP20396 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRHP20396 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TRHP20396 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRHP20396 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRHP20396 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRHP20396 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRHP20396 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRHP20396 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRHP20396 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRHP20396 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TRHP20396 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRHP20396 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRHP20396 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRHP20396 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRHP20396 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRHP20396 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRHP20396 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRHP20396 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRHP20396 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRHP20396 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRHP20396 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRHP20396 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRHP20396 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRHP20396 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TRHP20396 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRHP20396 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRHP20396 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRHP20396 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRHP20396 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRHP20396 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRHP20396 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRHP20396 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TRHP20396 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRHP20396 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRHP20396 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRHP20396 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRHP20396 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRHP20396 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRHP20396 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRHP20396 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TRHP20396 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRHP20396 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRHP20396 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TRHP20396 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRHP20396 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRHP20396 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRHP20396 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRHP20396 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRHP20396 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRHP20396 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRHP20396 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRHP20396 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRHP20396 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRHP20396 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TRHP20396 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRHP20396 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRHP20396 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRHP20396 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TRHP20396 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TRHP20396 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRHP20396 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRHP20396 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRHP20396 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRHP20396 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRHP20396 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRHP20396 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRHP20396 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRHP20396 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRHP20396 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRHP20396 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TRHP20396 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRHP20396 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TRHP20396 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRHP20396 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRHP20396 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRHP20396 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TRHP20396 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRHP20396 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRHP20396 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRHP20396 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRHP20396 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRHP20396 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRHP20396 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms