Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDSP20132 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDSP20132 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDSP20132 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDSP20132 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDSP20132 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDSP20132 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDSP20132 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDSP20132 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDSP20132 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDSP20132 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDSP20132 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDSP20132 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDSP20132 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDSP20132 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDSP20132 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDSP20132 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDSP20132 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDSP20132 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDSP20132 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDSP20132 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDSP20132 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDSP20132 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDSP20132 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDSP20132 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDSP20132 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SDSP20132 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SDSP20132 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDSP20132 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDSP20132 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDSP20132 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDSP20132 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDSP20132 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDSP20132 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDSP20132 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDSP20132 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDSP20132 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDSP20132 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDSP20132 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDSP20132 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDSP20132 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDSP20132 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDSP20132 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDSP20132 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDSP20132 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDSP20132 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDSP20132 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDSP20132 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SDSP20132 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDSP20132 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDSP20132 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDSP20132 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDSP20132 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDSP20132 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDSP20132 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDSP20132 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDSP20132 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDSP20132 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDSP20132 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SDSP20132 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SDSP20132 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDSP20132 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDSP20132 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDSP20132 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDSP20132 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDSP20132 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDSP20132 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDSP20132 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDSP20132 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDSP20132 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDSP20132 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDSP20132 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDSP20132 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDSP20132 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDSP20132 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDSP20132 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDSP20132 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDSP20132 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDSP20132 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDSP20132 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDSP20132 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDSP20132 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDSP20132 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDSP20132 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDSP20132 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDSP20132 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDSP20132 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDSP20132 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDSP20132 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDSP20132 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDSP20132 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SDSP20132 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDSP20132 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDSP20132 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDSP20132 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDSP20132 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDSP20132 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDSP20132 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDSP20132 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SDSP20132 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms