Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BMP3P12645 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BMP3P12645 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BMP3P12645 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BMP3P12645 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BMP3P12645 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BMP3P12645 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BMP3P12645 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BMP3P12645 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BMP3P12645 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BMP3P12645 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BMP3P12645 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BMP3P12645 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BMP3P12645 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BMP3P12645 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BMP3P12645 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BMP3P12645 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BMP3P12645 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BMP3P12645 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BMP3P12645 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BMP3P12645 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BMP3P12645 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BMP3P12645 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BMP3P12645 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BMP3P12645 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BMP3P12645 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BMP3P12645 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BMP3P12645 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BMP3P12645 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BMP3P12645 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BMP3P12645 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BMP3P12645 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BMP3P12645 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BMP3P12645 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BMP3P12645 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BMP3P12645 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BMP3P12645 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BMP3P12645 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BMP3P12645 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BMP3P12645 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BMP3P12645 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BMP3P12645 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BMP3P12645 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BMP3P12645 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BMP3P12645 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BMP3P12645 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BMP3P12645 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BMP3P12645 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BMP3P12645 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BMP3P12645 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BMP3P12645 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BMP3P12645 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BMP3P12645 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BMP3P12645 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BMP3P12645 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BMP3P12645 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BMP3P12645 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BMP3P12645 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BMP3P12645 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BMP3P12645 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BMP3P12645 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BMP3P12645 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BMP3P12645 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BMP3P12645 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BMP3P12645 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BMP3P12645 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BMP3P12645 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BMP3P12645 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BMP3P12645 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BMP3P12645 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BMP3P12645 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BMP3P12645 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BMP3P12645 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BMP3P12645 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BMP3P12645 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BMP3P12645 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BMP3P12645 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BMP3P12645 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BMP3P12645 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BMP3P12645 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BMP3P12645 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BMP3P12645 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BMP3P12645 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BMP3P12645 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BMP3P12645 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BMP3P12645 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BMP3P12645 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BMP3P12645 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BMP3P12645 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BMP3P12645 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BMP3P12645 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BMP3P12645 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BMP3P12645 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BMP3P12645 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BMP3P12645 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BMP3P12645 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BMP3P12645 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BMP3P12645 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BMP3P12645 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BMP3P12645 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms