Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR2F1P10589 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms