Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGPD2P0DJD1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms