Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD1P0DJD0 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms