Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC166P0CW27 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms