Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN7O94888 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms