Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNKO75909 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNKO75909 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNKO75909 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNKO75909 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNKO75909 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNKO75909 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNKO75909 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNKO75909 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNKO75909 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNKO75909 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNKO75909 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNKO75909 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNKO75909 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNKO75909 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNKO75909 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNKO75909 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNKO75909 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNKO75909 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNKO75909 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNKO75909 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNKO75909 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNKO75909 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNKO75909 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNKO75909 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNKO75909 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNKO75909 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNKO75909 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNKO75909 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNKO75909 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNKO75909 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNKO75909 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNKO75909 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNKO75909 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNKO75909 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNKO75909 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNKO75909 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNKO75909 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNKO75909 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNKO75909 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNKO75909 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNKO75909 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNKO75909 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNKO75909 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNKO75909 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNKO75909 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNKO75909 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNKO75909 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNKO75909 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNKO75909 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNKO75909 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNKO75909 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNKO75909 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNKO75909 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNKO75909 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNKO75909 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNKO75909 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNKO75909 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNKO75909 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNKO75909 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNKO75909 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNKO75909 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNKO75909 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNKO75909 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNKO75909 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNKO75909 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNKO75909 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNKO75909 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNKO75909 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNKO75909 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNKO75909 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNKO75909 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNKO75909 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNKO75909 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNKO75909 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNKO75909 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNKO75909 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNKO75909 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNKO75909 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNKO75909 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNKO75909 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNKO75909 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNKO75909 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNKO75909 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNKO75909 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNKO75909 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNKO75909 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNKO75909 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNKO75909 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNKO75909 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNKO75909 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNKO75909 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNKO75909 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNKO75909 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNKO75909 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNKO75909 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNKO75909 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNKO75909 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNKO75909 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNKO75909 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms