Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SIN3BO75182 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms