Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD2O60548 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms