Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPF3O43395 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF3O43395 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms