Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP9YO00507 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP9YO00507 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP9YO00507 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP9YO00507 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP9YO00507 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP9YO00507 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP9YO00507 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP9YO00507 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP9YO00507 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP9YO00507 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP9YO00507 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP9YO00507 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP9YO00507 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP9YO00507 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP9YO00507 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP9YO00507 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP9YO00507 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP9YO00507 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP9YO00507 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP9YO00507 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP9YO00507 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP9YO00507 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP9YO00507 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP9YO00507 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
USP9YO00507 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
USP9YO00507 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP9YO00507 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
USP9YO00507 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
USP9YO00507 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP9YO00507 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP9YO00507 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP9YO00507 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP9YO00507 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP9YO00507 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP9YO00507 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP9YO00507 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP9YO00507 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP9YO00507 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP9YO00507 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
USP9YO00507 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP9YO00507 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP9YO00507 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP9YO00507 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP9YO00507 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP9YO00507 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP9YO00507 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP9YO00507 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP9YO00507 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP9YO00507 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP9YO00507 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP9YO00507 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP9YO00507 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP9YO00507 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP9YO00507 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP9YO00507 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
USP9YO00507 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
USP9YO00507 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP9YO00507 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP9YO00507 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9YO00507 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9YO00507 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9YO00507 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9YO00507 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9YO00507 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9YO00507 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9YO00507 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9YO00507 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9YO00507 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9YO00507 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9YO00507 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9YO00507 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9YO00507 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9YO00507 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9YO00507 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9YO00507 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9YO00507 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9YO00507 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9YO00507 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9YO00507 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9YO00507 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9YO00507 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9YO00507 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9YO00507 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9YO00507 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9YO00507 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9YO00507 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9YO00507 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9YO00507 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9YO00507 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9YO00507 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9YO00507 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9YO00507 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9YO00507 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9YO00507 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP9YO00507 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP9YO00507 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP9YO00507 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP9YO00507 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP9YO00507 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms