Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KPNA3O00505 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms