Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKBIEO00221 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKBIEO00221 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms