Protein–RNA interactions for Protein: C9JVI0

USP17L11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L11C9JVI0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP17L11C9JVI0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms