Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HHLA1C9JL84 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms