Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STRCP1A6NGW2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms