Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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