Protein–RNA interactions for Protein: V9GXZ4

FPGT-TNNI3K, FPGT-TNNI3K readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms