Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC61Q9Y6R9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC61Q9Y6R9 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms