Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GJA3Q9Y6H8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJA3Q9Y6H8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GJA3Q9Y6H8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJA3Q9Y6H8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJA3Q9Y6H8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJA3Q9Y6H8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GJA3Q9Y6H8 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GJA3Q9Y6H8 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJA3Q9Y6H8 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJA3Q9Y6H8 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJA3Q9Y6H8 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GJA3Q9Y6H8 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GJA3Q9Y6H8 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GJA3Q9Y6H8 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GJA3Q9Y6H8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GJA3Q9Y6H8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJA3Q9Y6H8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJA3Q9Y6H8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJA3Q9Y6H8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJA3Q9Y6H8 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJA3Q9Y6H8 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJA3Q9Y6H8 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJA3Q9Y6H8 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJA3Q9Y6H8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GJA3Q9Y6H8 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJA3Q9Y6H8 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJA3Q9Y6H8 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms