Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.27■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.27■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.27■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AFG3L2Q9Y4W6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms