Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SBNO2Q9Y2G9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SBNO2Q9Y2G9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms