Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RNF6Q9Y252 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms