Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXL4Q9UKA2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FBXL4Q9UKA2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms