Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFT172Q9UG01 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
IFT172Q9UG01 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms