Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLIP2Q9UDT6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms