Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GDAP2Q9NXN4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms