Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms