Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM7SF3Q9NS93 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TM7SF3Q9NS93 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms