Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLCO1B3Q9NPD5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms