Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-5Q9HDB9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms