Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KATNB1Q9BVA0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms