Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TINF2Q9BSI4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TINF2Q9BSI4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms