Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRG3Q99928 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms