Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL1Q96FI4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL1Q96FI4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms