Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CELF1Q92879 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms