Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCSTNQ92542 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms