Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBY8

PMFBP1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMFBP1Q8TBY8 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PMFBP1Q8TBY8 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMFBP1Q8TBY8 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMFBP1Q8TBY8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMFBP1Q8TBY8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMFBP1Q8TBY8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMFBP1Q8TBY8 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMFBP1Q8TBY8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PMFBP1Q8TBY8 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PMFBP1Q8TBY8 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMFBP1Q8TBY8 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMFBP1Q8TBY8 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMFBP1Q8TBY8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMFBP1Q8TBY8 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMFBP1Q8TBY8 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMFBP1Q8TBY8 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMFBP1Q8TBY8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMFBP1Q8TBY8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMFBP1Q8TBY8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMFBP1Q8TBY8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMFBP1Q8TBY8 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMFBP1Q8TBY8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMFBP1Q8TBY8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PMFBP1Q8TBY8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PMFBP1Q8TBY8 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PMFBP1Q8TBY8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PMFBP1Q8TBY8 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PMFBP1Q8TBY8 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PMFBP1Q8TBY8 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PMFBP1Q8TBY8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PMFBP1Q8TBY8 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PMFBP1Q8TBY8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PMFBP1Q8TBY8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PMFBP1Q8TBY8 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PMFBP1Q8TBY8 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PMFBP1Q8TBY8 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PMFBP1Q8TBY8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PMFBP1Q8TBY8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PMFBP1Q8TBY8 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PMFBP1Q8TBY8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PMFBP1Q8TBY8 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PMFBP1Q8TBY8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PMFBP1Q8TBY8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PMFBP1Q8TBY8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PMFBP1Q8TBY8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PMFBP1Q8TBY8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms