Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00612Q8N6U2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms