Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGSF1Q8N6C5 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms