Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL0

NAV3, Neuron navigator 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAV3Q8IVL0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAV3Q8IVL0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms